เรื่องราวการประจันหน้ากันระหว่างคู่ปรับที่ตำนานที่ต่อสู้กันอย่างน่าตื่นตาตื่นใจมาย่างช้านาน โดยมีโชคชะตาของโลกห้อยอยู่บนเส้นขนาน คอง และก็ผู้ดูแลของเขาข้อตกลงกันว่าจะยอมเสี่ยงอันตรายเสี่ยงตายเพื่อหาบ้านที่ตามที่เป็นจริงของเขา โดยมี จีอา (เคย์ลี ฮอตเทิล) สาวน้อยลูกกำพร้าร่วมทางไปกับพวกเขาจนกระทั่งกำเนิดความสัมพันธ์อย่างเหนียวแน่นและไม่ราวกับผู้ใด แม้กระนั้นพวกเขากลับจำต้องเจอหน้ากับ ก็อดสิลล่า ที่กำลังบ้าคลั่ง ปลดปล่อยรัศมีการล้มล้างกระจัดกระจายไปทั่วทั้งโลก การประจันหน้ากันระหว่างสองยักษ์ใหญ่มีเหตุมาจากพลังที่ไม่เห็น ซึ่งเป็นจุดเริ่มแรกของปัญหาที่หลบอยู่ในใจกึ่งกลางของโลก